Tutorial Chem Sketch 3l1q5y

ACD/ChemSketch freeware for Microsoft Windows

Tutorial Drawing Chemical Structures and Graphical Image

Para obter a versão free e: http://www.acdlabs.com/resources/freeware/chemsketch/

1. Utilização do programa:  

ACD / ChemSketch Freeware é um pacote de desenho que lhe permite desenhar estruturas químicas, incluindo compostos orgânicos e organometálicos, polímeros entre outras estruturas e desenhos. Também inclui funcionalidades tais como o cálculo de propriedades moleculares (por exemplo, o peso molecular, densidade, refratividade molar, etc), visualização e animação de estruturas 2D e 3D, funcionalidade para nomear as estruturas (com menos de 50 átomos e três anéis), e previsão de logP. A versão freeware do ChemSketch não inclui todas as funcionalidades da versão comercial.   2. Instalação da versão free: Para instalar a versão free no seu computador, e: http://www.acdlabs.com// Irá aparecer a tela, conforme figura abaixo, clique em , conforme indica a seta na figura abaixo.

 

Após será necessário fazer o seu cadastro no site. Clique em Created an , conforme indica a seta abaixo.  

 

Faça o seu cadastro preenchendo os dados conforme figura abaixo. Quando aparecer o símbolo * é obrigatório o preenchimento do campo. Para finalizar clique em , conforme indica a seta na figura abaixo.  

 

Abrirá a tela abaixo. Clique em

, conforme seta na figura abaixo.  

 

Clique em , conforme seta abaixo.  

 

Clique em Save e escolha o lugar para salvar no seu computador.  

 

Para facilitar o o ao programa pode-se colocar um atalho na área de trabalho

.  

  3.

Abrindo o programa ACD / ChemSketch  

Depois de ACD / ChemSketch foi instalado no seu computador, siga estes os básicos para iniciá-lo: 1. Iniciar do Microsoft Windows. 2. Dê um duplo clique no ícone ChemSketch (se ele não estiver na sua área de trabalho, direcione-se até onde o programa ChemSketch está e de o duplo clique).  

3. Você deverá ver uma tela de abertura. Se esta é a versão freeware, você vai ver o ACD / Labs Products. Clique em OK para fechá-lo.  

 

4. Utilizando o programa ACD / ChemSketch 4.1 Structure (Estrutura) e Draw (desenhar)   Quando ACD / ChemSketch inicia, você vai encontrar muitos comandos do menu e botões da barra de ferramentas aparecer esmaecido (inativos). Elas serão disponibilizadas tão logo você desenhar uma estrutura. Na janela ChemSketch, existem dois modos, Struture e Draw. Você pode alternar entre eles usando os botões no canto superior esquerdo (indicados pela seta na figura abaixo):  

 

No modo estrutura (Struture) você pode desenhar estruturas e esquemas de reação, enquanto o modo de desenho (Draw) apresenta-lhe as ferramentas para a inserção de texto e desenho de vários objetos gráficos.    

   

4.1.1 Explicando a janela inicial   Os nomes e as posições das barras de ferramentas, para ser utilizado em todo o tutorial, são introduzidos neste item.   4.1.1.1 Modo de Estrutura   Abaixo você pode ver a tela com o Modo de Estrutura habilitado (observando a palavra Structure em destaque).  

  A figura acima demonstra a tela de trabalho que será descrita abaixo:   1. A primeira barra é chamada Barra de título e mostra o nome do programa e o nome do arquivo atualmente aberto.   2. A segunda barra é a Barra de menu contém uma série de palavras. Cada palavra é um link para abrir uma lista ('menu') de comandos relacionados para trabalhar na janela no modo estrutura e desenho.   3. A terceira barra é a Barra de ferramentas geral que inclui ferramentas que estão presentes tanto no modo estrutura, quanto no modo de desenhar e irá ajudá-lo com as tarefas pertinentes a ambos os modos, tais como: salvar, abrir arquivos, desfazer/refazer operações, copiar e colar, mais ou menos zoom, bem como a inserção de vários modelos.   4. A quarta barra é a Barra de ferramentas ChemBasic é opcional e contém extras ou outras aplicações ChemBasic - ferramentas para desenho e manipulação de estruturas químicas - que serão detalhadas no decorrer desse tutorial. Ela é colocada logo acima do espaço de trabalho e só existe no modo estrutura.  

5. Na vertical à esquerda tem-se a Barra de ferramentas dos átomos contém botões que representam átomos, bem como ferramentas para alterar as propriedades dos átomo (carga, valência, numeração, etc).   6. Colocado à direita da janela tem-se a Barra de referência que contém a tabela de radicais e vários botões que representam radicais prontos para você utilizar no desenho de suas estruturas 2D.   7. A área de trabalho (workspace) é o espaço em branco, no meio, onde as estruturas são desenhadas.   8. Embaixo da área de trabalho (workspace) tem-se a paleta de cores que permite, rapidamente, a troca de cores dos átomos e laços nas estruturas químicas que foram desenhadas por você anteriormente. Nesta barra, a esquerda, estão as cores mais usadas, seleciona-se primeiramente o que deseja alterar a cor na área de trabalho e depois clica-se sobre a cor. Mais cores podem ser escolhidas clicando sobre more (mais) no canto direito desta mesma barra.   9. Abaixo da paleta de cores tem-se a Barra de descrição do programa, não utilizada por você.   10. Abaixo da barra de descrição do programa tem-se a Barra de status que mais a esquerda contém informações que podem ser úteis para a sua localização no momento atual: o nome do arquivo, ficheiro que está trabalhando, o número de página no arquivo, número de fragmentos no espaço de trabalho, a fórmula molecular da estrutura selecionada, bem como uma das propriedades químicas disponíveis para a estrutura selecionada. Ela também contém um botão de o I-Lab automático que permite seu ao programa. E mais a direita, você pode clicar, com o botão esquerdo do mouse em properties (propriedades) irá aparecer as propriedades do átomo e/ou da estrutura desenhada você pode marcar qual você prefere que apareça nessa barra.   NOTA: Observe figura abaixo. As barras de ferramentas podem ser personalizadas usando o ‘menu de atalho’ (que aparece quando você clique com o botão direito na barra de ferramentas). As seguintes opções estão disponíveis no menu: botões da barra de ferramentas exibe todos os botões disponíveis na barra de ferramentas. Se você não quer que os botões sejam exibidos na barra de ferramentas, desmarque-os neste menu de atalho. Redefinir Barra de Ferramentas, seleciona todos os botões da barra de ferramentas no menu de atalho. Chevron-Style adiciona mais botões no final da barra de ferramentas (exibe todos os botões quando não cabem na barra de ferramentas); Wrap Style divide a barra em duas partes (uma sob a outra) se os botões não cabem na barra de ferramentas.  

 

  4.1.1.2 Modo de Desenho   Abaixo você pode ver a tela com o modo de desenho ativada (observando a palavra Draw em destaque).  

A barra de título, de menu e de ferramentas geral tem a mesma designação que para o modo Estrutura. Para relembrar consulte a seção 4.1.1.1 Modo de Estrutura.    

1. A quarta barra é a Barra de ferramentas de edição está presente apenas no modo de desenhar. Ele incorpora ferramentas de edição e manipulação de objetos de desenho gráfico.   2. Verticalmente à esquerda da tela tem-se a Barra de ferramentas desenho que contém botões para desenhar vários objetos gráficos e texto.   3. A área de trabalho (workspace) é a área branca aberta no meio onde os objetos gráficos são desenhados e texto é digitado.   4. A Paleta de cores, no fundo da área de trabalho, como no modo estrutura, permite que você, rapidamente, altere a cor de objetos selecionados.   5. A Barra de status, exatamente como descrito na seção anterior, contém informações que podem ser úteis, como guia, no momento atual: o nome do arquivo que você está trabalhando, o estado do documento, o número da página, entre outras.   Observação: Para obter informações sobre como personalizar as barras de ferramentas, por favor, leia a NOTA na seção anterior.     5.

Saindo do programa ACD / ChemSketch  

Você pode sair do programa em qualquer uma das seguintes maneiras: 1. Clique em Fechar no canto superior direito da barra de título de qualquer janela. 2. A partir do menu ACD/Labs, escolha exit all (fechar tudo). Esta vai tentar fechar todos os programas de ACD/Labs que estão abertos, um por um. 3. No menu file (arquivo), escolha exit (sair). Isto irá fechar apenas o arquivo atualmente aberto.   Você será avisado para salvar seu trabalho, nos formatos adequados, em função da janela que você está saindo.   6. Desenho de estruturas simples em 2D   Esta seção considera as noções básicas de desenho no modo Estrutura e pretende dar uma visão geral dos recursos de desenho disponíveis no ACD/ ChemSketch (freeware), como:   Desenhar átomos considerando: suas ligações (simples, duplas, triplas); coordenações; características químicas;   2. Desenhar estrutura molecular;   3. Selecionar, girar e redimensionar as estruturas desenhadas;   1.

Certifique-se de que você está no Modo de Estrutura para todas as seguintes ações:   6.1.1. Desenho de átomos e estruturas   Como fazer: A ferramenta Desenhar Normal é ferramenta padrão quando o programa for iniciado. Neste modo, você pode facilmente desenhar um átomo no seu estado normal, ramificado e em correntes e substituir os átomos com outros átomos da tabela periódica dos elementos.   1. Certifique-se a ferramenta desenhar normal é ativado na barra de ferramentas Estrutura e que o átomo de carbono é selecionado na barra de ferramentas Átomos, conforme indica os círculos na figura abaixo.  

2. Clique em um espaço vazio para desenhar CH4 NOTA: Para desenhar de forma padrão conforme descrito nessa seção e necessário verificar o comando conforme figura abaixo. Na barra de menu clique em Options – Set Structure Drawing Style – Normal. Para mudar para qualquer outro padrão que você necessite é só marcar o estilo desejado.  

 

3. Clique em CH4 para adicionar um grupo -CH3, criando CH3-CH3 com um comprimento de ligação padrão. Clique duas vezes no mesmo carbono para desenhar a estrutura visualizada na figura abaixo.  

4. Clique em Configurar ligação verticalmente , na barra de ferramentas Estrutura, e clicar em qualquer ligação da estrutura para girá-lo para essa orientação, demonstrada na figura abaixo:    

 

Observação: os botões ao lado desse descrito nesse item também servem para girar a sua estrutura para diferentes direções. Dica: teste todos e verifique o que mais se adapta ao que você necessita.   6. Clique sobre o átomo de carbono mais à direita para desenhar essa estrutura:  

 

NOTA: Para copiar a estrutura desenhada, conforme estrutura acima, clique em Edit – Select All, vai aparecer a estrutura selecionada (figura abaixo) então aperte Edit – Copy (ou as teclas de atalho Ctrl+C) e depois ‘cole’ no documento desejado, ou no mesmo documento, se for o caso.

7. Repita o o anterior para desenhar as seguintes estruturas:  

 

                     

                   

8. Para acrescentar ligações duplas clique uma vez na ligação simples já desenhada:  

9. Para acrescentar uma ligação tripla clique duas vezes na ligação simples já desenhada.  

 

10. Clique na ligação tripla ou dupla para torná-las uma ligação simples novamente.   Observação: Para os itens acima o botão de desenhar normal selecionado.  

deve estar

11. Para fazer uma ramificação maior clique no botão e vá para a área de trabalho clique com o botão esquerdo do mouse e arraste para o lado desejado até ter o número de átomos que você deseja.  

 

12. Para desfazer ou refazer as estruturas clique no botão correspondente (botões em seta vermelha, na barra de ferramentas).   13. Você pode apagar os átomos que tenha colocado a mais, como o botão (botão com uma borracha, na barra de ferramentas), clicando neste e clicando em cima do átomo que se deseja excluir.   14. Para substituir um átomo vá na barra de ferramenta de átomos, a esquerda da área de trabalho, clique no átomo desejado e na estrutura clique no átomo que você deseja substituir, exemplo abaixo, substituição de C por F.

 

Ou, se o elemento não estiver na barra de ferramentas Átomos, clique na Tabela Periódica , na barra de ferramentas Átomos para abrir a tabela periódica dos elementos, escolha o átomo desejadoe clique em OK. Note que este átomo vai estar na barra de ferramentas átomos a partir de agora.  

 

15. Para desenhar estruturas cíclicas, na barra de ferramentas a direita da área de trabalho clique na estrutura desejada e clique na área de trabalho. Da mesma maneira que descrito acima, você pode substituir os átomos dessas estruturas já desenhadas.

16. Para acrescentar um dos radicais existentes nesta barra de ferramentas, selecione o radical desejado e clique em cima do átomo, na estrutura já desenhada, que se deseja ligar este radical.

Observação: para apagar essa estrutura inteira clique na borracha e clique na parte branca da área de trabalho, toda estrutura vai ficar selecionada, então aperte o botão delete do seu teclado. 17. Para desenhar estruturas mais complexas o programa tem uma biblioteca de estruturas prontas. Clique em Templates window na barra de ferramentas e vai surgir uma tela como a da figura abaixo.Deixe structure selecionado, conforme figura, e escolha a estrutura desejada no menu a esquerda, no exemplo Alkaloids. Selecione a estrutura desejada clicando sobre ela, você pode escolher através da barra ou trocando de página com o auxílio desses

botões , a janela Templates window vai se fechar, então clique na área em branco para inserir a estrutura desejada.

NOTE: Você pode trocar a cor dos números ou átomos selecionando o que você deseja alterar com um clique sobre e indo na patela de cores e clicando na cor desejada ou em more na mesma barra e clicando sobre a cor desejada:

7. Para Limpar a tela   Se você tiver que limpar a tela, você pode fazer uma das seguintes opções:   1. Clicando em new document (documento novo) , na barra de menu.   2. No menu file (arquivo), selecione new (novo). Isto irá abrir um novo documento. 3. Na barra de menu clique em Pages (Páginas) - new (nova) para inserir uma nova página vazia.   4. No menu Edit (Editar), escolha Select all (Selecionar tudo) e, em seguida, no mesmo menu edit, escolha delete.    

8. Salvando as estruturas   Assim que uma ou mais estruturas que você desenhou estiverem prontas pode salvá-las em um arquivo, imprimi-las, ou inseri-las em outras aplicações como o MS Word, Excel, etc.   8.1 Salvando em um arquivo:   1. No menu file (arquivo), selecione salve as (salvar como), vai aparecer uma caixa de diálogo, conforme a da figura abaixo. Escolha em que pasta (save in) você deseja salvar no seu computador, o nome do arquivo (file name) e a extensão que deseja salvar (save as type), clique em Save.  

NOTA: É importante observar o tipo de arquivo que se deseja salvar. No próprio formato do programa (*.sk2) é possível editar a figura. Um formato padrão compartilhada por muitos programas é o formato *.mol, ele não salva

imagens gráficas, textos, só mantém a estrutura molecular. Em *.gif ou *.png mantêm a imagem gráfica. Escolha e melhor extensão para o seu caso, as disponíveis irão aparecer na caixa de diálogo, conforme figura abaixo.

 

9. Incorporando a estrutura em um documento  

Para inserir a estrutura em um relatório escrito em outras aplicações, por exemplo, um documento Word, planilha Excel, etc.:   1. Selecione a estrutura necessária, usando o botão de seleção , na barra de menu e selecionando a figura segurando o botão esquerdo do mouse arrastando a seta ao redor da estrutura desejada, você vai observar que a estrutura vai ficar marcada. Ou clique em edit (editar) - select all (selecione tudo).   2. Para copiar a seleção para a Área de Transferência, clique em copy (copiar), na barra de menu. Ou pressione Ctrl+C ou ainda, na barra de menu, edit (editar) – copy (copiar).   3. Alterne para a aplicação onde deseja que a estrutura seja inserida e usando a função Colar do pedido ‘cole’ sua estrutura no documento desejado.   Observação: Para colocar uma imagem da estrutura, use o recurso Colar Especial no aplicativo que você está colando. Entre as opções de colagem escolher o ACD ChemSketch 2.0 Object ou a opção Imagem. Permitindo, assim, que você edite a estrutura inserida via ChemSketch, clicando duas vezes sobre a imagem.